Foldit/ University of Washington
Bild VergrößernGamer klären Struktur von HIV-Protein
28.09.2011 - Computerspielern ist es gelungen, die Struktur eines Virus-Enzyms aufzuklären. Mit der frei verfügbaren Software „Foldit“ konnten sie ein genaues 3-D-Modell des Proteins erstellen - mehr als hundert Gamer waren dabei beteiligt. Die Ergebnisse könnten eines Tages dazu beitragen, die Ausbreitung von HIV einzudämmen.
Die Struktur eines Proteins bestimmt seine Funktion. Ist sie bekannt, lassen sich passgenaue Medikamente entwickeln, um das Protein auszuschalten. Auch im Kampf gegen den HI-Virus setzen Wissenschaftler auf Wirkstoffe, die gezielt Erregerproteine angreifen und so verhindern, dass er sich ausbreiten kann. Doch immer wieder scheitern Forscher daran, die Proteinfaltung aufzuklären. Denn schon ein kleines Protein besteht aus mehr als 100 Aminosäuren, potenziell sind unendlich viele Variationen möglich.
Spieler lieferten entscheidende Impulse
Mit dem Online-Game „Foldit“ ist in nur 3 Wochen das gelungen, was Forscher seit Jahren versucht hatten. Mehr als hundert Spieler und Spielergruppen konnten die Struktur einer retroviralen Protease - ein HIV-Enzym - entschlüsseln. Besonders von zwei der Gruppen stachen hervor: Sie lieferten entscheidende Impulse zur Aufklärung der Struktur. Dafür werden sie als Autoren des Artikel im Fachmagazin Nature Structural & Molecular Biology (2011, Onlineveröffentlichung) genannt: die Foldit Contenders Group und die Foldit Void Crusher Group.
Spieler schlagen Algorithmen
Bei "Foldit“ bekommen die Spieler eine Reihe von Werkzeugen in die Hand, um die langen Nukleinsäuren auf immer neue Art, aber nach bestimmten Regeln ineinanderzuschachteln. Der Spieler faltet das Protein, indem er dessen Seitenäste schüttelt, mit seiner Hauptstruktur wackelt, Verschlüsse öffnet oder Verbindungen schafft. Diese Vorgänge finden auch in der Natur statt. Für sich genommen sind sie einfach, insgesamt aber gibt es so viele Gestaltungsmöglichkeiten, dass selbst die besten Computerprogramme kapitulieren. Die besten menschlichen Spieler von "Fold it" hingegen schlagen die bisher verwendeten Algorithmen der Forscher mit Leichtigkeit.
laborwelt.de/tk










